台灣已於2025年提前達成世界衛生組織消除C型肝炎的目標，然而相較於C型肝炎已有明確的國家級消除計畫，B型肝炎防治仍尚有努力空間，台灣醫界聯盟基金會董事長吳樹民表示，台灣政府在 1986 年施行新生兒全面接種B肝疫苗，讓台灣在 B 肝防治取得亮眼的成績。但目前仍有未受疫苗保護的40 歲以上民眾，持續受到健康威脅。要做到消除B肝，設立國家級的政策將是關鍵。吳樹民呼籲，台灣應該要提升B肝防治的政策層級，制定「國家消除B型肝炎政策綱領」，將B肝消除的政策拉高到國家層級，投入更多資源，才能達到消除肝炎的目標。

國立臺灣大學公共衛生學系陳秀熙教授則指出，台灣透過推動新生兒B肝疫苗政策，成為全球公共衛生典範，贏下比賽的「上半場」；然而，面對成人B肝帶原者的長期照護，台灣仍須打好防治的「下半場」。B肝不同於C肝，整體病程更長，從感染、纖維化、肝硬化到肝癌，是一段漫長的疾病進程。雖然健保已提供B肝帶原者定期接受腹部超音波及甲型胎兒蛋白檢查，但過去定期篩檢者僅約兩成，持續追蹤比例更不到三成，顯示從感染發現到後續追蹤的照護鏈仍有缺口，是台灣接下來要加強努力的地方，40歲以上的B肝患者經常合併糖尿病、高血壓、脂肪肝及代謝症候群，應整合既有慢性病的照護體系，建立慢性肝病共同照護網，並運用AI進行智慧化個案管理與風險預警，提升民眾的警覺性及追蹤意願，協助患者及早進入醫療照護系統。

台灣肝臟研究學會會長、高雄醫學大學校長余明隆醫師則表示，台灣應借鏡C肝消除經驗，成立國家級B型肝炎消除辦公室、編列專款預算，並針對篩檢、診斷、追蹤及治療設定明確指標，避免政策推動受到年度預算及資源波動影響。余明隆指出，台灣現行B肝治療評估較C肝複雜，必須綜合e抗原、HBV DNA病毒量、肝纖維化程度及肝指數等四項要素，但目前台灣曾接受病毒量等完整評估的患者僅約三分之一，代表許多帶原者即使知道自己感染，仍可能未被辨識出治療需求。現行P4P追蹤制度主要著重肝指數及腹部超音波等肝癌監測，未完整納入治療評估項目；未來應擴大陽性追蹤涵蓋率，力求讓九成B肝帶原者進入長期追蹤系統。

臺大醫院內科部、肝炎研究中心蘇東弘主治醫師指出，現行B肝口服抗病毒藥物雖能有效抑制病毒，但與C肝接受兩至三個月療程即可治癒不同，B肝患者通常需要數年甚至十數年的長期治療。但就像早年不曾想過C肝可以治癒，隨著新藥持續發展，C肝走到可以透過二到三個月療程達到治癒。

台灣醫界聯盟基金會執行長林世嘉說，下一階段的B肝政策如何升級，台灣醫界聯盟認為應聚焦四大方向，包括：將B肝防治提升至國家消除戰略層級，制定國家級B肝消除綱領、加強主動篩檢與轉介，找出並接住感染者、優化給付與照護模式，擴大治療可近性與涵蓋率，讓B肝防治取得突破。