環境部推動流域治理與工程設施，去年全國河川嚴重汙染測站降到歷史新低，只剩北港溪和平橋與二仁溪五空橋水質汙染較嚴重。水質保護司長王嶽斌表示，有7成河川在整治資源的投入下，水質穩定改善，但有3成河川受到氣候變遷的影響，例如地震崩塌土石鬆軟以及強降雨沖刷等，水質較沒有改善。為持續提升河川水質治理效能，將持續精進法規配套與設施，削減各類汙染源。
臺南市環保局長許仁澤分享急水溪與二仁溪水域治理經驗，許仁澤表示，臺南境內有八掌溪、急水溪、曾文溪、鹽水溪及二仁溪五大河川，早期治理過程面臨極大挑戰。臺南市針對畜牧業密集的急水溪流域，採取集中處理策略。在環境部補助下，八翁酪農區共同處理設施第一期已完工，主要處理牛隻廢水，第二期正動工處理豬隻廢水，預計未來可以處理該區85%的畜牧污染。
新北市環保局主任秘書許明志分享，淡水河流域治理已久，嚴重污染河段長度已經從110年的5.1%降到去年的0.2%，水質指標RPI朝未遭受污染邁進。許明志表示，目前新北市污水下水道接管戶數已經突破120萬戶，為全國最高。
環境部表示，近期也陸續發布修正水污許可審查辦法、地面水體分類及水質標準，也透過飲用水新興汙染物管理以及發布稽查管制指引，強化高汙染風險對象控管，確保飲用水安全。