在副總統蕭美琴監交下，陳建仁院士自廖俊智院長手中接下中央研究院印信，正式成為第13任中研院院長。副總統蕭美琴說，新任院長陳建仁兼具卓越學術成就與豐富公共服務經驗，是備受敬重的國際流行病學專家。面對氣候變遷、地緣政治、淨零轉型及人工智慧等全球挑戰，期盼中研院能夠發揮深厚的研究能量與廣泛的國際視野，以學術回應社會需求，培育更多優秀人才，提升臺灣的國際競爭力與影響力。蕭副總統也代表總統及全體國人，向卸任院長廖俊智表達誠摯感謝。她指出，廖院長任內推動制度革新、人才培育及南部院區建設，為臺灣科研發展奠定深厚基礎。

前總統蔡英文也受邀出席院長交接典禮，曾親自遴選廖俊智為院長的蔡前總統，對廖院長十年長滿白髮感到歉疚。她回憶，十年前任命廖院長接掌中研院，當時深信廖院長深厚的學術成就、國際視野，及返臺承擔責任的情懷，必能為臺灣科學界持續發展注入力量。十年後再回顧，廖院長以扎實的院務推動與豐碩成果，充分回應了當年的期許與信任。蔡前總統表示，陳院長具備豐富的學術與行政治理經驗，待人任事始終展現科學家的嚴謹、自信與堅韌，以及溫暖敦厚的人格特質。她相信，陳院長能以堅定的行動力與對臺灣社會的深切關懷，帶領中研院持續前行。

廖俊智院長回顧兩屆任期中，確立了南部院區量子及淨零的特色、改革人事考核制度，並在AI主導 的新科學時代推動頂尖研究，彷彿是「不可能的任務」。卸任後，他將擔任中研院生物化學研究所特聘研究員，繼續協助跨領域團隊在減碳議題的合作。

新任院長陳建仁畢業於國立臺灣大學動物學系，並取得美國約翰霍普金斯大學流行病學博士學位。研究專長為流行病學、人類遺傳學、公共衛生與預防醫學，是國際知名的烏腳病與慢性砷中毒，以及肝炎病毒與肝癌的研究專家。陳院長上任前為中研院基因體研究中心特聘研究員，曾任國立臺灣大學公共衛生學院院長、中研院副院長、行政院衛生署署長、國科會主任委員、副總統及行政院院長，尤其在SARS與COVID-19期間，帶領臺灣成功防疫，兼具深厚學術成就與豐富公共治理經驗。新任院長陳建仁表示，在中研院迎來百年之際，他將推動五大方向，包含持續追求學術卓越、深化國際連結、協助公共政策、強化人才培育及建構負責任的AI制度。

陳建仁院長也宣布三位副院長名單，分別為原子與分子科學研究所特聘研究員周美吟院士、分子生物研究所特聘研究員蔡宜芳院士，以及經濟研究所特聘研究員彭信坤院士；原副院長唐堂院士卸任。周美吟及蔡宜芳副院長都曾榮獲「台灣傑出女科學家獎」的殊榮，留任的彭信坤副院長則在中研院服務超過40年，自稱「中研院的園丁」，三位人選兼顧數理科學、生命科學、人文及社會科學三大領域均衡發展。陳院長期許，未來行政團隊將持續營造優質研究環境，促進跨領域合作與國際交流，共創新局。